近年来，本草物质组计划的提出备受业界关注，得到了国内相关研究机构的肯定，也使得中药行业为之振奋和鼓舞。本草物质组计划是针对中药研究所面临的问题而提出的，这些问题包括：多组分、多靶点、整合调节理论尚未得到系统验证；中药研究技术和产品不标准；中药物质基础和作用机理仍不清晰；标准化的中药组分资源和信息资源匮乏。本草物质组计划就此提出要依靠现代科技手段，通过方法学和关键技术上的创新和发展，对本草物质基础进行系统、深入的解析。分离材料的研发是高通量制备与表征的基础，大力发展基质材料，并在基质材料的基础上设计多种新型的、系列的功能分离材料以适应中药复杂体系的分离分析要求，去解释中药为什么能治病，这无疑是一条可能会在中药研究上取得突破的道路。必须掌握所有中药的物质信息，清楚所有的靶点以及靶点之间的生理、病理特别是与中医疾病、证候的关系。最后要解决的还是中药的疗效问题，研究结果无非是对疗效的阐明而已。
　 而要达到这个目标首先应该解决的核心问题是：必须掌握所有中药的物质信息，清楚所有的靶点以及靶点之间的生理、病理特别是与中医疾病、证候的关系。最后要解决的还是中药的疗效问题，研究结果无非是对疗效的阐明而已。
　　实际上，所有关于中药现代化、国际化的话题都是围绕着中成药展开的，并不涉及传统的临床中药，但后着正是中医药的精华所在。从某种意义上说，中成药不能代表中药，至少不能代表中医药理论的核心和特点，甚至其是否属于传统中药都尚需讨论。比如，传统的临床中药离不开临床辨证、因人施治，其间的变化和差异很大，非中医医师是不能开出临床处方的，但现在相当数量的中成药为非中医医师所使用，没有中医药理论，不知道处方和剂量，当然不能达到因人施治的目的。本草物质组计划的基本设想是一切处于“假定不变”的前提之下，但实际上，疾病及其发展过程是千变万化的。
　　让世界了解中药、接受中药是一件造福人类的好事，有人质疑中药也不需要因此而寝食不安，关键是应该把中药的事做好，即做好自己的事，首先造福中国人民，这是第一位的。就中成药而言，已经上市的产品有几千种，现在应继续说明那些药品可以被认为是中药，有什么效果，怎样制备才合理，能够控制什么检测指标，不能检测的如何控制质量，治疗何种疾病，以及可行的中药评价模式是什么等，其意义可能大于对中药为什么能治病的解释。如果不能说明以上问题，可能就应该将相当数量的中成药从市场中清理出去。